吉林大学第二医院儿内科前身系伪满新京特别市立医院儿科，1948年10月长春解放后儿科也迎来新时代，1965年病房、门诊先后迁至一院。1984年我院重新组建儿科，床位30张。2014年开始我院成立了“儿科疾病诊疗中心”，儿内科为亚专科之一，至2025年11月科室有医生22人，其中博士7人，硕士13人；护士50人；技术员3人；科室先后特聘两位国内、国际知名教授，上海交通大学附属上海儿童医学中心免疫科陈同辛教授（擅长儿童免疫缺陷病及过敏性疾病的精准诊疗）与上海交通大学附属第六人民医院内分泌科刘丽梅教授（开创了中国糖尿病精准医学的里程碑）。现有床位63张。内设小儿呼吸、神经、血液、心肾风湿病、消化、内分泌及遗传代谢病组等，配备了国内领先的医疗设备，如小儿电子纤维支气管镜，肺功能仪，呼出气NO仪，动态脑电图仪，脑彩超等；拥有可以检测15项小儿临床常见化验项目的化验室；并于2024年开始配备了免疫治疗室，可进行变应原皮肤点刺试验，食物激发试验，变应原特异性免疫治疗等多项操作。是长春市重点专科，国家级住院医师规范化培训基地，吉林省全科医师规范化培训基地。吉林省妇幼保健协会儿科专业分会主任委员单位。

医疗方面，与国内、省内多家医院密切协作，实现疑难重症病例的远程会诊，建立双向转诊绿色通道，开展医护技术人员的进修培养，线上线下专业技术培训等。内分泌组省内率先开展儿童、青少年糖尿病如MODY、线粒体糖尿病、单基因糖尿病，及1型、2型糖尿病的精准分型、诊疗；包括先进的实时动态血糖监测和胰岛素泵系统；肾脏病组省内率先开展、目前也是唯一能开展儿童肾脏疾病腹膜透析的治疗，现已完善了自动化腹膜透析机、艾考糊精透析液等多种治疗手段，弥补了我省终末期肾脏病儿童治疗的空白；血液肿瘤组除进行常规血液系统疾病的规范诊治，与儿童外科、骨科等联合进行小儿常见肿瘤的术前术后评估及化疗；呼吸、过敏免疫组联合皮肤科、眼科、耳鼻喉科开展儿童过敏性疾病多学科联合诊治，实现了多种疾病院内MDT诊疗模式，诊疗水平达到省内先进水平。积极参加抗疫、扶贫、支边、义诊等各种医疗救助任务。

教学方面，儿科教研室建科后即承担本科生和硕士研究生教学。2014年开始承担儿科、全科住院医师规范化培训和新生儿专培的教学。现有教授、副教授11人，其中博士生导师2人、硕士生导师7人。承担省级、校级二十余项教学课题研究。发表教学论文四十多篇。多名教师获教学奖。教学形式多样化，理论课、技能操作、实习课均采用线上线下混合教学模式。两次获得人卫在线课程和微视频比赛二等奖。教研室获得吉林大学第二医院2021、2022年度“教学管理优秀奖”；2023年度教学管理优秀教研室；2024年度教学管理突出教研室；

科研方面，近年来我科先后承担了国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金青年基金3项、吉林省自然科学基金、吉林省财政厅卫生专项项目、吉林省国际合作项目、吉林省卫生健康适宜技术扶贫项目、吉林省卫生健康提升项目等省部级项目40余项，科研经费400多万元，获科研成果奖7项，国家级专利1项，实用新型专利2项。近5年发表SCI杂志、核心期刊论文100余篇。定期举办吉林省儿科学术研讨会和国家级、省级继续教育学习班。