吉林大学第二医院1998年2月成为国家药品临床研究基地（编号：JDX1999029）拥有皮肤及妇产两个专业；2006年6月获得SFDA批准成为国家药物临床试验机构（证书编号：20060046-0154），拥有呼吸、肾病、内分泌、心血管、皮肤、妇产六个临床专业；2012年7月通过SFDA国家药物临床试验机构复核检查（证书编号：XF20120130）。2013年5月获得CFDA批准（证书编号：20120043-0432），增加消化、神经内科、血液、肿瘤、眼科、普通外科六个专业。
　　机构建立了专门的机构办公室及资料档案室，并配备相关人员，包括机构主任、机构办公室主任、办公室秘书、机构质控员、并与药品管理部合作，下设药品管理员；各专业设立有受试者接待室、临床实验药品库及临床试验办公室，设有药品管理员负责药品接收、发放及回收，相关文件资料、病历档案由项目组长负责管理；由专业负责人和项目负责人对在研项目进行质量监控。相关专业人员均接受GCP知识及药物临床试验技术的培训，制定了药物临床试验相关管理制度、SOP和实验设计规范。
　　药物临床试验机构到目前为止累计承接临床试验项目近180项，近三年承接近89项，其中药物临床试验52项，器械临床试验37项。

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　2014年12月