马忠森教授现任吉林省医学会呼吸病学分会、长春市医学会呼吸病学分会主任委员及吉林省医学会结核学分会副主任委员等职，一直工作在医疗、教学和科研第一线，临床工作经验丰富，在工作实践中勇于开拓进取，有奉献精神、遵守职业道德,热情为群众服务，受到群众和业内同行好评。

       马忠森教授在突发公共卫生事件中为吉林省的广大群众的生命安全作出了卓越贡献,为我省减少巨大的经济损失。在2004年吉林市中百商厦2.15火灾后立即赶赴现场，奋战了7个日日夜夜；在抗击“非典”工作中，进行“SARS”防治的培训及讲座12次；培训800多人次，排查非典患者接触人员4000余人，会诊300余人次。在SARS中心病房一次连续工作28天；长春市结核病医院留观病房工作10天。有一次连续工作13小时，是我省在“SARS”病房中工作时间最长、年龄最大、职称和资历最高的一名医生；禽流感防治工作方面，每次马教授都亲临现场，及时地排除了禽流感的诊断，患者得到了准确治疗，使患者和国家都减少了经济损失；抗洪救灾、支农等都第一批到灾区、第一批下乡。

       带领下级医师早在1996年开展肺动脉造影、支气管动脉造影、支气管动脉栓塞术、下腔静脉滤器植入术、经皮穿刺肺活检、经纤支镜肺活检、经纤支镜纵隔淋巴结活检、经皮胸腔穿刺导管植入持续排液排气术、目前为止，是我省唯一由呼吸内科医生进行肺部疾病介入治疗的科室，还开展了经纤支镜气管内支架植入术、气管镜下微波治疗气道狭窄等。提高了我省呼吸系统疾病如大咯血、肿瘤、肺栓塞、弥漫性间质性肺疾病、呼吸衰竭、胸膜等疾病的诊断和治疗水平。

       1995年-2005年任诊断学教研室主任，1999年-现在又兼任内科教研室主任，一直组织教学工作和承担五年制、六年制、七年制临床医学系、口腔医学系、妇幼卫生系、医学信息等专业内科学和诊断学主讲任务，在教学管理和实践教学中做了大量工作。为人师表，言传身教，在传授知识的同时进行医德医风教育，让学生懂得医生所肩负的责任，理解救死扶伤的真正含义。